Cette collection s'est constituée à partir du XVIIIe siècle et se caractérise par deux grands ensembles : d'une part, les ouvrages publiés par les académiciens à titre personnel et ceux résultant des travaux de l'Académie elle-même, et d'autre part, le fonds contemporain en histoire des sciences constitué à partir de 1989 sous l'impulsion de Christiane Demeumenaere-Douyère, conservatrice en charge des Archives.